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中疾控周报:本轮广东疫情Delta变异毒株潜伏期仅4.4天

2021-07-05 10:09:59来源:健康时报网|分享|扫描到手机
阅读提要:“近期在广州出现的疫情是Delta变异株在中国本土引发的首次聚集性疫情。研究人员发现,Delta变异株的平均潜伏期仅为4.4天,比2020年武汉报告的5.2天要短。”《中国疾病预防控制中心周报(英文)》在线发表文章披露了广东省5月、6月新冠变异毒株Delta(B.1.617.2)传播特点。

“近期在广州出现的疫情是Delta变异株在中国本土引发的首次聚集性疫情。研究人员发现,Delta变异株的平均潜伏期仅为4.4天,比2020年武汉报告的5.2天要短。”《中国疾病预防控制中心周报(英文)》在线发表文章披露了广东省5月、6月新冠变异毒株Delta(B.1.617.2)传播特点。

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广州市番禺区中心医院医护人员正在采集核酸,资料图片。

Delta变异毒株10天在本土导致了5代传播

文章显示,2021年5月21日,中国广东省广州市荔湾区,一名于5月18日出现症状的75岁妇女被确诊为新型冠状病毒本土病例。在接下来的10天里,感染人数激增,导致5代传播。截至6月23日,在广东省4个城市(广州、茂名、佛山和湛江)共观察到167例与此次疫情相关的本土传播病例。

科研人员从最初确诊的5例病例的拭子样本中提取出病毒核糖核酸,并将他们的病毒基因组序列与武汉最初分离到的新冠病毒Wuhan-Hu-1基因组进行对比,发现相比Wuhan-Hu-1,这5个毒株的基因组序列分别为99.89%、99.85%、99.86%、99.86%和99.87%。根据“Pango 谱系”规则,这5种毒株属于Delta变异株。

2020 年 10 月,Delta在印度首次被发现。据世界卫生组织,截至2021年6月8日,Delta已迅速蔓延至全球74个国家和地区。

研究者指出,疫情的快速蔓延突显了这种变异株的高度传染性。初期24起聚集性传播中的68例感染者有着清晰的传播链,基于此,研究者分析了该病毒的潜伏期(从感染到发病的时间)、代际间隔(原发病例和继发病例间的感染间隔)、系列间隔(原发病例和继发病例的发病间隔)等关键传播参数。

平均潜伏期仅为4.4天,代际间隔2.9天

基于属于24个具有明确传播链的集群的最初68例感染,研究者通过数据分析发现,Delta变异株的平均潜伏期仅为4.4天,比2020年武汉报告的5.2天(2020年3月发表于《新英格兰杂志》)要短。病毒传播的平均代际间隔为2.9天,比之前湖南报告的5.7天也要短得多。

64.7%的传播在病例出现症状之前

研究者还发现,64.7%的传播事件发生在症状出现前阶段,高于湖南省的报告59.2%(2021年3月发表于《自然通讯》)。传播参数表明,抑制这种突变病毒的快速传播和隐藏传播是当务之急。

传播能力比以前的毒株高了一倍

根据5月18日至5月29日发病或通知的病例数据,以及2.9天的平均世代时间,研究人员估计了基本再生数(R0),即一个病例将产生的额外病例的预期数量。通过最大似然法估计的基本再生数R0为3.2,远高于武汉市报告的2.2。

根据代际间隔和R0的估计值,研究者估计疫情早期的传染增长率(r,代表了传染病的传播率)约为0.76每天,这比以前的流行株高了100%。这个结果与Finlay等人报告的Delta变异株传染力提高97% (2021年6月发表于《欧洲监控》)相一致。

为了应对这一前所未有的威胁,广东省采取了一系列严格的干预措施,包括大规模检测、发现阳性病例、社区管理、旅行限制和疫区封锁,以遏制疫情。证据表明,广东采取的公共卫生措施对疫情产生了影响。

继连续10日无新增新冠肺炎本土病例,7月2日,国务院联防联控机制综合组广东工作组人员全部撤离广东省。同日,广东省疫情防控措施作出调整,广州市密闭娱乐场所、旅游景区密闭室内部分等有序开放;取消广佛“持48小时核酸证明出省”要求;取消除深圳、东莞两市外其他地市持“72小时核酸证明出省”管控措施。(赵萌萌 邱越编译

参考资料:

①《Notes from the Field: Transmission Dynamics of an Outbreak of the COVID-19 Delta Variant B.1.617.2 — Guangdong Province, China, May–June 2021》,China CDC Weekly,2021.6.29’

②《Notes from the Field: Genome Characterization of the First Outbreak of COVID-19 Delta Variant B.1.617.2 — Guangzhou City, Guangdong Province, China, May 2021》;China CDC Weekly,2021.7.2;

③Li Q, Guan XH, Wu P, Wang XY, Zhou L, Tong YQ, et al. Early transmission dynamics in Wuhan, China, of novel coronavirus–infected pneumonia. N Engl J Med 2020;382(13):1199 − 207.

(责任编辑:孙宝光 实习编辑:刘予欣)

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