重庆市肿瘤医院胃肠外科副主任医师蒋又新介绍说，“胃间质瘤往往难以早期发现，且易被误诊。”胃肠间质瘤可发生在消化道的任何部位，以胃最为常见，所以长期被误认为是平滑肌瘤、平滑肌肉瘤，也常与胃肠道神经鞘瘤和胃肠道自主神经瘤混淆。在首次就诊的胃肠间质瘤患者中，约有20%~30%的患者已发展成为晚期;有11%~47%的患者已发生肝转移和腹腔转移，错过了最佳治疗时机。
究其原因，是因为胃肠间质瘤不仅病程早期症状隐秘，其临床症状也无特异性可言。如果病灶在胃部，可能会表现为消化不良、胃痛、上腹不适，也有部分是消化道出血。如果病灶在小肠，则可能表现为腹痛、消化不良;如果病灶在直肠，则可能引起大便困难、异物感、里急后重等。
