反复发作呼吸暂停及低通气会导致反复的低氧血症或高碳酸血症，损害多种脏器，逐渐发展将导致心血管系统、呼吸系统、神经系统、内分泌系统、泌尿系统等并发症。因此治疗时应根据患者的病情轻重、病变部位、医生的经验综合判断。