肺部疾病千变万化，即便检查检验也不一定能够分辨得开，易造成误诊，有些肺炎可能被误诊为肺癌，有些是肺癌在CT上看起来像是炎症。
隐球菌感染就是一种非常容易当做肺癌的感染。经常接触鸟类且免疫力低下的人群易被感染，在肺部常表现成小结节，但也有肿块等其他形态的患者。它和肺癌结节很难鉴别，甚至做昂贵的PET-CT检查也难以鉴别，隐球菌甚至还会感染骨和脑，和肺癌脑转移和骨转移非常类似。每年都会有一些隐球菌感染者被当做肺癌手术的病例，术前基本上无法区分二者。
肺癌在临床上可算是最奇怪的疾病了，我们常有一句不正式的经验总结，凡是治来治去好不了，症状还逐渐加重的肺部疾病，都不能忘记肺癌。肺癌虽然是一种病，但各种各样的肺癌有好多种，其中有一种叫做支气管肺泡细胞癌，这个类型的肺癌有时候会伪装成肺炎，且容易早期就侵犯多个肺叶发展成晚期，其最特征性的表现就是大量白色泡沫痰，一天吐一到两杯(一次性水杯)，诊断起来有时也是相对困难，因为不管是穿刺还是气管镜取到的标本都充满着液体，细胞被稀释以至于显微镜下都难以分辨。
疾病的诊断最怕的就是误诊漏诊，尤其是肺癌，无论是其他疾病误诊成肺癌，还是肺癌误诊成其他疾病，对患者都难以承受，而诊断最重要的方法就是取标本病理活检。