浙江大学医学院附属第二医院消化内科邵黎明：目前认为，萎缩和肠化是胃癌的癌前期病变之一，也就是说有萎缩和肠化会增加胃癌的风险。由于幽门螺杆菌与萎缩肠化密切相关，因此，如果萎缩肠化的患者同时有幽门螺杆菌感染，建议根除。除非有特别禁忌或药物过敏。虽然根除幽门螺杆菌仅可能部分逆转萎缩，不能逆转肠化，但能阻止萎缩肠化进一步进展。此外，目前没有一种药物能确切逆转萎缩肠化。
由于萎缩肠化的主要风险是胃癌，因此推荐对萎缩肠化的患者进行胃镜筛查和随访，一旦发现有早期癌变，可通过内镜下微创治疗的办法进行局部治疗，而不需切除大部分或整个胃。
对于内镜随访的时间间隔，通常认为，对于重度萎缩肠化的患者，需要半年到1年进行胃镜复查，轻中度萎缩肠化可以1到3年进行胃镜复查。